Rica em diversidade de espécies, a Mata Atlântica está entre as cinco regiões do mundo com maior número de espécies endêmicas. Os animais podem ser considerados generalistas ou especialistas.
Os generalistas apresentam hábitos alimentares variados, alta taxa de crescimento e dispersão; vivem em áreas de vegetação aberta e secundária, tolerantes e capazes de aproveitar diferentes recursos oferecidos pelo meio ambiente. Os animais especialistas são mais exigentes em relação aos habitats nos quais vivem, com dieta específica, uma alteração no meio ambiente exige dos animais especialistas a procura de novos habitats.
Grupos da Mata Atlântica :
Mamíferos
Das cerca de 460 espécies de mamíferos brasileiros conhecidas até hoje, cerca de 130 vivem na Mata Atlântica. Possivelmente, 50 delas existem somente ali. Ou seja, são endêmicas da Mata Atlântica.
O Brasil é o terceiro país do mundo mais rico em mamíferos, perdendo apenas para a Indonésia e o México. Há cerca de 58 espécies de mamíferos brasileiros ameaçadas e 14 delas estão na Mata Atlântica. Veja algumas:
guariba ruivo
guariba-do-nordeste
macaco-prego
macaco-prego-de-peito-amarelo
mico-leão (dourado, preto, de cara-dourada e de cara-preta)
sagui-da-serra
sagui-da-serra-escuro
cachorro-do-mato-vinagre
gato-do-mato
jaguatirica
lontra
maracajá
muriqui (ou mono-carvoeiro)
onça-pintada
ouriço-preto [endêmico]
preguiça-de-coleira
rato-do-mato (ferrugíneo e laranja)
suçuarana
tamanduá-bandeira [praticamente extinto]
tatu-canastra
veado-campeiro
Ainda podemos encontrar:
anta
capivara
cateto ou caititu
caxinguelê (caticoco ou serelepe)
cuíca
cuíca d'água
cutia
furão
gambá
irara
jupará
mão-pelada
ouriço-cacheiro
paca
preá
quati
queixada
ratão-do-banhado
tamanduá-mirim
tapiti
veado-catingueiro
veado-mateiro
Aves
Calcula-se que no Brasil vivem 1622 espécies de aves, das quais cerca de 620 localizam-se na mata Atlântica. Algumas já estão totalmente desaparecidas.
O Brasil possui mais aves do que toda a África do Sul, o Oriente e a Austrália. E é o terceiro no mundo em número de espécies de aves, perdendo apenas para Colômbia e Peru. Das mais de 100 espécies de aves ameaçadas no Brasil, 78 possivelmente estão na Mata Atlântica. Veja alguns exemplos:
mutum-do-nordeste (restam apenas alguns em cativeiro)
mutum-do-sudeste
arara-azul-pequena
Outras, numerosas, estão seriamente ameaçadas de extinção, como:
anambé-de-asa-branca
anambezinho
apuim-de-cauda-amarela
apuim-de-cauda-vermelha
arapaçu-do-nordeste
araponga-do-nordeste
bacurau
besourão-de-rabo-branco
bicudo
cameleirinho-de-chapéu-preto
caminheiro-grande
chauá-verdadeiro
choquinha
cigarra-verdadeira
codorna mineira
crejoá
falcão-de-peito-amarelo
fura-mato
gavião-de-penacho
gavião-pomba
gavião-pombo-grande
gavião-preto
guará
harpia
jacu-verde
jacuaca
jacutinga
jaó-do-sul
macuco
mãe-da-lua
mergulhão
negrinho-do-mato
papa-formiga
papa-mosca-estrela
papagaio-charão
papagaio-de-cara-roxa
papagaio-de-peito-roxo
patinho-gigante
pavão-do-mato
pica-pau-de-cara-amarela
pica-pau-rei
pintassilgo-do-nordeste
pintor-verdadeiro
pomba de espelho
rabo-amarelo
sabiá-castanho
sabiacica
sabiá-da-mata-virgem
sabiá-pimenta
saí-de-pernas-pretas
saíra-apunhalada
socó-boi
tesoura-do-campo
tesourinha
tiê-de-coroa
tiriba
Mas ainda há aves que vivem no que restou das matas:
arara
arara-vermelha-grande
arara-canindé
atobá
bacurau
bico-de-lacre
bem-te-vi
coruja
caracará
garça
gaivota
jandaia
maitaca
martim-pescador
maçarico
papagaio
pato-mergulhão
pica-pau
periquito
periquito-maracanã
quiriri
quero-quero
saracura
socó-boi
sabiacica
saíra
tiê-sangue
tico-tico
tucano-de-bico-preto
urubu
Anfíbios
Apresentam formas de reprodução estrategicamente diversificada. Na Mata Atlântica há cerca de 370 espécies de anfíbios, sendo 90 endêmicas.
Répteis
O Brasil é o quarto no mundo em diversidade de répteis, perdendo somente para o México, a Austrália e a Indonésia. Segundo estimativas, são 467 espécies de répteis, das quais as principais são:
Quelônios
cágado
jabuti
tartaruga marinha
Ofídios
coral-verdadeira
coral-falsa
jararaca
jararacuçu
jibóia
surucucu-bico-de-jaca
Lacertídios
calango
iguana
jacaré-do-papo-amarelo [em extinção]
lagartixa-de-areia
teiú
Peixes
A Mata Atlântica possui cerca de 350 espécies de peixes, sendo 113 endêmicas. O endemismo é justificado pelo isolamento da área em relação das demais bacias hidrográficas.